Il s'agit bien sûr du réseau de métro qui sillonne Gotham Harbor, Midtown, l'East End et le Hill.
Il fut construit sur la demande de Thomas Wayne. Un projet ambitieux visant à donner à la ville son premier moyen de transport accessible à tous pour accélérer l'économie tout en veillant à en faire profiter les plus pauvres. Plus tard, quand Bruce Wayne succéda à son père, il chargea Lucius Fox d'améliorer ce réseau et ce fut chose faite.
Aujourd'hui, tous les métros de Gotham fonctionnent à partir d'un système électrique auto-alimenté. L'énergie provient de panneaux solaires et les frictions provoquées par les métros eux-même sont recyclées en énergie. Ainsi, le faible coût en électricité du réseau Gotham City Rail permet de rendre les transports gratuits pour toute la population.
Le problème reste encore et toujours la criminalité. Il ne fait pas bon d'être seul dans un wagon une fois la nuit tombée...
